ロゴスの授業の特徴は、いわゆる少人数制指導授業ですが、詰め込みスタイルの小さな教室を使用するのではなく、生徒一人ひとりがゆったり学習できるスペースを確保しています。講師と生徒、生徒と生徒との間に適度な距離と空間を設けられるように配慮しています。
最大24名がゆったり使える教室が大教室。合同テストや説明会などを実施したり、普段の授業でも使用しています。
最大9名がゆったり使える中教室が3室、２名で使える教室が３室あります。講師との距離も近く、密度の高い授業を受けることができます。
個別指導を行うための専用個室（10室）です。ゆったりとしたスペースで、周りに気兼ねすることなく落ち着いて受講することができます。
談話スペースには飲料販売機、電子レンジ、ポットが常備してあります。食事をとったり、雑談したりと、生徒の憩いの場となっています。新聞の医療関連記事も読むことができます。
希望する生徒には、授業の教室とは別に自習専用個別ブースを設けることもできます。パーテーションで仕切られた机2個分の広々とした空間のため、参考書を並べたり、時間割を貼ったりと、生徒一人ひとりが自分だけの空間を作って集中して自習に取り組んでいます。自習室は8：00から22：00まで使用可能です。
講師室には各大学の過去問題集や赤本がおよそ1000冊保管されています。コピー機も無料で使用できるため、気になる大学の過去問題をいつでもコピーして演習することもできます。
志望校合格に必要なのは学力だけではありません。強い精神力や体調・健康管理・生活面での様々なサポートが必要です。ロゴスの事務局では、講師だけではフォローできないメンタル面でのサポートやカウンセリングを行ったり、時には講師とのパイプ役を果たします。
また、受験生と年齢の近い現役の医大生をチューターとして採用しています。数年前に医大受験を突破した経験から、勉強以外の相談にものってくれることもあり、頼れる心強い先輩でもあります。スタッフのアットホームな雰囲気や関わりがロゴス特有の温かさを作り、受験生にとっての励みになっています。
